MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_5p

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018884	ATT	2	6	210	215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403588
2	NC_018884	TTG	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403588
3	NC_018884	CAA	2	6	248	253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
4	NC_018884	A	6	6	252	257	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
5	NC_018884	TGT	2	6	325	330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403588
6	NC_018884	GTA	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403588
7	NC_018884	CATT	2	8	371	378	25 %	50 %	0 %	25 %	514403588
8	NC_018884	AGA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
9	NC_018884	CAAA	2	8	442	449	75 %	0 %	0 %	25 %	514403588
10	NC_018884	AGA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
11	NC_018884	A	6	6	644	649	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
12	NC_018884	TAGAAG	2	12	687	698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514403588
13	NC_018884	AGT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403588
14	NC_018884	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
15	NC_018884	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
16	NC_018884	CAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
17	NC_018884	A	7	7	839	845	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
18	NC_018884	AAAAG	2	10	847	856	80 %	0 %	20 %	0 %	514403588
19	NC_018884	GAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
20	NC_018884	AAC	2	6	943	948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403588
21	NC_018884	GAA	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
22	NC_018884	GA	3	6	1018	1023	50 %	0 %	50 %	0 %	514403588
23	NC_018884	A	6	6	1058	1063	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
24	NC_018884	AGA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
25	NC_018884	ATA	2	6	1122	1127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403588
26	NC_018884	AGA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
27	NC_018884	AAT	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403588
28	NC_018884	AGA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
29	NC_018884	TAAA	2	8	1206	1213	75 %	25 %	0 %	0 %	514403588
30	NC_018884	A	6	6	1295	1300	100 %	0 %	0 %	0 %	514403588
31	NC_018884	TTA	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403588
32	NC_018884	AAG	2	6	1402	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403588
33	NC_018884	AAAAG	2	10	2714	2723	80 %	0 %	20 %	0 %	514403589
34	NC_018884	AAG	3	9	2752	2760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403589
35	NC_018884	AAAGT	2	10	2841	2850	60 %	20 %	20 %	0 %	514403589
36	NC_018884	T	6	6	2898	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	514403589
37	NC_018884	GAA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403589
38	NC_018884	ATTGT	2	10	2962	2971	20 %	60 %	20 %	0 %	514403589
39	NC_018884	ATTC	2	8	2979	2986	25 %	50 %	0 %	25 %	514403589
40	NC_018884	ATT	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403589
41	NC_018884	ATT	2	6	3162	3167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403589
42	NC_018884	AAC	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403589
43	NC_018884	TTTA	2	8	3209	3216	25 %	75 %	0 %	0 %	514403589
44	NC_018884	A	6	6	3237	3242	100 %	0 %	0 %	0 %	514403589
45	NC_018884	T	6	6	3256	3261	0 %	100 %	0 %	0 %	514403589
46	NC_018884	A	6	6	3830	3835	100 %	0 %	0 %	0 %	514403590
47	NC_018884	TTA	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403590
48	NC_018884	TATTT	2	10	3856	3865	20 %	80 %	0 %	0 %	514403590
49	NC_018884	T	6	6	3863	3868	0 %	100 %	0 %	0 %	514403590
50	NC_018884	TGC	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514403590
51	NC_018884	ATT	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403590
52	NC_018884	AAG	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403590
53	NC_018884	AATG	2	8	3980	3987	50 %	25 %	25 %	0 %	514403590
54	NC_018884	AGA	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403590
55	NC_018884	TA	3	6	4018	4023	50 %	50 %	0 %	0 %	514403590
56	NC_018884	AATG	2	8	4070	4077	50 %	25 %	25 %	0 %	514403590
57	NC_018884	AAT	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403590
58	NC_018884	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403590
59	NC_018884	AT	3	6	4182	4187	50 %	50 %	0 %	0 %	514403590
60	NC_018884	CAG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514403590
61	NC_018884	TAG	2	6	4218	4223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403590
62	NC_018884	CAA	2	6	4289	4294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403590
63	NC_018884	ACT	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403590
64	NC_018884	TTTA	2	8	4443	4450	25 %	75 %	0 %	0 %	514403590
65	NC_018884	A	7	7	4479	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	514403590
66	NC_018884	TGGTTC	2	12	4528	4539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	514403590
67	NC_018884	TAA	2	6	4637	4642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403590
68	NC_018884	TAA	2	6	4681	4686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403591
69	NC_018884	GTTTT	2	10	4723	4732	0 %	80 %	20 %	0 %	514403591
70	NC_018884	A	6	6	4752	4757	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
71	NC_018884	TA	4	8	4760	4767	50 %	50 %	0 %	0 %	514403591
72	NC_018884	AT	3	6	4808	4813	50 %	50 %	0 %	0 %	514403591
73	NC_018884	TAT	2	6	4887	4892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403591
74	NC_018884	A	6	6	4911	4916	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
75	NC_018884	A	7	7	4959	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
76	NC_018884	A	6	6	5001	5006	100 %	0 %	0 %	0 %	514403591
77	NC_018884	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403591

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.